Kementerian Pariwisata telah mengumumkan lima tujuan wisata paling populer di Yogyakarta. Kelima situs tersebut dinamai sebagai kawasan strategis pariwisata nasional dan diprioritaskan untuk pengembangan. Dengan demikian, kini Jogja memiliki lima wilayah strategis pariwisata nasional.
Kelima wisata tersebut adalah Gunung Merapi dan Gunung Merbabu, Candi Prambanan di Kalasan Kabupaten Sleman yang akan segera memiliki Jembatan Handayani, dan Keraton di Kotagede. Yang lainnya adalah kawasan karst di Gunung Kidul, termasuk di Wonogiri dan Pacitan, yang terkenal sebagai Gunung Sewu Geopark.
Tujuan wisata favorit terakhir terletak di sepanjang pantai selatan Yogyakarta. Mulai dari Pantai Baron, Pantai Krakal, dan yang di daerah barat yaitu Pantai Parangtritis, Pantai Depok, Pantai Trisik di Kulonprogo, hingga pantai di Purworejo hingga Kebumen. Selain itu, salah satu acara program yang dijuluki ‘sunset run’ yang akan diadakan di masa depan mungkin menjadi merek pariwisata baru di Bantul.